(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210540803.0 (22)申请日 2022.05.17 (71)申请人 华中农业大 学 地址 430070 湖北省武汉市洪山区狮子山 街1号 (72)发明人 李凤娥　徐文宁　李珍珠　陈亚茹　 陈大可　陈高贵　 (74)专利代理 机构 武汉宇晨专利事务所(普通 合伙) 42001 专利代理师 张红兵 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 MMP2基因多态性作为猪产仔数性状的遗传 标记及应用 (57)摘要 本发明属于猪遗传标记筛选领域， 具体涉及 MMP2基因多态性作为猪产仔数性状的遗传标记 及应用。 从MMP2 基因内含子13 上克隆得到遗传标 记， 序列如SEQ  ID NO： 1或SEQ  ID NO： 2所示。 公 开了猪MMP2基因内含子13上SNP位点及其SNP分 型的检测方法， MMP2 基因内含子13 上存在一个等 位基因(A/T)突变， 引起BgIII ‑RFLP多态性。 其 中： TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因 型； AA基因型的经产死胎数显著高于TA基因型； AA基因型的总胎次死胎数极显著高于TA 基因型； AA基因型的总胎次产活仔数显著高于TA 基因型， TA基因型是减少死胎数有 益基因型。 可用于 大白 猪活产仔数和死胎数性状的检测。 权利要求书2页 说明书7页 序列表2页 附图3页 CN 114836544 A 2022.08.02 CN 114836544 A 1.一种与猪产仔数性状相关的SNP遗传标记， 所述猪品种为大白猪， 所述性状为活产仔 数和死胎数性状， 所述SNP遗传标记的核苷酸序列如下 所示： TGGTCCCTTCCCACAACAAGCCCACCTCTCATGCCAGGGTCTGGAATGGTCAGCCTGCTCTACAGAGGAGGC TCTGGGAGTCTTCCCTCAAA GCAGCAGAACTGAGGAAGTTCCCATTGTGGCCCA GTGGAAACGAATCTAACTA GTA TCCATGAA GATGCATGTTCGATCCCCA GCCTTGTTCA GTGGGTCAA GGATCCGGCATTGCCATGA GCTATGGTGGA GGTCACAGATGCAGCTCCGATTCTGCGTTGCTGTGGCTGTGATGTA GGCTGGCA GCTGCAGCTCCGATTTGATTCC TAGCCTGGGATCTTCCATATGCCACAA GTGTGGCCCTAAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCA GC AAAACGGAAACATCTATTGAA GGCTCTGGGTGGGTTTCCA GAGGAGACRGATCTTTTTCCCA GGGGAGGTGGTGAA TGAGCTGAAGCCATTGGTCCCACTGTA GAGTCGGCAAAGGCCCGGGCCTCCTTGCTGGA GAAGGAAAGCCCCAGAA CAATGCAGGATAAGCA GCTGCTTCCA GCAAAAGCAACCCCTA GCTCATGCCA GGATGTGCTTAGCCTTTGCTTCTG GAAGCTTCCATTAA GCCCACAAAAATACATGCAATACCTCTTGTGTGCCA GGCACTTATCTA GGTGCTGCAA GACA ATGGTAAAAACACA GTCACTCTCAAGA GTTTCCACTGTGTCACACTGGATTAA GAATCTGACTGCA GCAGCAAGGG TCGCTATGGA GGTGCAGGTTCAATCCCTA GCCCAGCGCAGTGAGTTCAGGGATTCACCTTTGCTGTATCGGCA GTG TAGGTTG， 上述序列中第425 碱基位的R是A或T， 该突变引起BgI II酶切位点多态性。 2.一种检测猪MMP2基因分型的标记引物， 所述猪品种为大白猪， 所述性状为活产仔数 和死胎数性状， 其特 征在于， 所述引物的DNA序列如SEQ  ID NO:3和SEQ  ID NO:4所示； 其中： TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因型； AA基因型的经产 死胎数显著高于TA基因 型； AA基因型的总胎次死胎数极显著 高于TA基因型； AA基因型的总胎次产活仔数显著 高于 TA基因型， TA基因型 是减少死胎数有益基因型。 3.一种筛选与猪产仔数性状相关的SNP遗传标记的方法， 其特征在于， 所述猪品种为大 白猪， 所述筛 选方法包括如下步骤： 从大白猪血液或毛发中提取基因组DNA， 登录Ensembl数据库下载MMP2基因序列， 从测 序结果中寻找SNP位点， 确定该SNP位点的内切酶， 设计如SEQ  ID NO： 3和SEQ  ID NO： 4所示 的特异引物； 以大白猪基因组DNA 为模板进 行PCR扩增， 利用单核苷 酸多态性检测， 对基因型 与产仔数性状间进行相关性分析。 4.一种SNP遗传标记在猪产仔数性状标记辅助选择中的应用， 所述猪品种为大白猪， 所 述性状为活产仔数和死胎数性状， 所述SNP遗传标记核苷酸序列如下所示： TGGTCCCTTCCCA CAACAAGCCCACCTCTCATGCCA GGGTCTGGAATGGTCA GCCTGCTCTACAGA GGAGGCTCTGGGA GTCTTCCCTC AAAGCAGCAGAACTGAGGAAGTTCCCATTGTGGCCCA GTGGAAACGAATCTAACTA GTATCCATGAA GATGCATGT TCGATCCCCA GCCTTGTTCA GTGGGTCAA GGATCCGGCATTGCCATGA GCTATGGTGGA GGTCACAGATGCAGCTC CGATTCTGCGTTGCTGTGGCTGTGATGTA GGCTGGCA GCTGCAGCTCCGATTTGATTCCTA GCCTGGGATCTTCCA TATGCCACAA GTGTGGCCCTAAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA GGCAGCAAAACGGAAACATCTAT TGAAGGCTCTGGGTGGGTTTCCA GAGGAGACRGATCTTTTTCCCA GGGGAGGTGGTGAATGA GCTGAAGCCATTGG TCCCACTGTA GAGTCGGCAAA GGCCCGGGCCTCCTTGCTGGA GAAGGAAAGCCCCAGAACAATGCA GGATAAGCAG CTGCTTCCA GCAAAAGCAACCCCTAGCTCATGCCA GGATGTGCTTA GCCTTTGCTTCTGGAA GCTTCCATTAA GCC CACAAAAATACATGCAATACCTCTTGTGTGCCA GGCACTTATCTA GGTGCTGCAA GACAATGGTAAAAACACA GTC ACTCTCAA GAGTTTCCACTGTGTCACACTGGATTAA GAATCTGACTGCA GCAGCAAGGGTCGCTATGGA GGTGCAG GTTCAATCCCTAGCCCAGCGCAGTGAGT TCAGGGATTCACCTTTGCTGTATCG GCAGTGTAG GTTG，权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114836544 A 2上述序列中第425 碱基位的R是A或T， 该突变引起BgI II酶切位点多态性； 其中： TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因型； AA基因型的经产死胎数显著高于 TA基因型； AA基因型的总胎次死胎数极显著 高于TA基因型； AA基因型的总胎次产活仔数显 著高于TA基因型， ， TA基因型 是减少死胎数有益基因型。 5.一种标记引物在大白猪产仔数性状基因分型中的应用， 所述猪品种为大白猪， 所述 性状为活产仔数和死胎数性状， 所述标记引物 的DNA序列如序列表SEQ  ID NO:3和SEQ  ID  NO:4所示。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114836544 A 3