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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210467306.2 (22)申请日 2022.04.29 (71)申请人 西南民族大 学 地址 610041 四川省成 都市武侯区一环路 南四段16号 申请人 阿坝藏族羌族自治州畜牧科 学技术 研究所 (72)发明人 李志雄 陈立英 吴锦波 林亚秋 熊燕 (74)专利代理 机构 成都坤伦厚朴专利代理事务 所(普通合伙) 51247 专利代理师 吴亦雨 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01)C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种SESN2基因SNP标记检测藏鸡经济性状 的方法及其应用 (57)摘要 本发明属于分子生物学检测领域, 具体涉及 一种SESN2基因SNP标记检测藏鸡经济性状的方 法及其应用。 具体技术方案为: 一种影响藏鸡性 状的SNP分子标记, 所述SNP分子标记位于藏鸡 SESN2基因对参考序列Genbank Accession No.NC_052554的第8644位点的碱基处, 突变碱基 为C或T。 本发明首次发现, 藏鸡 SESN2基因第8644 位处, 如果发生C ‑T突变, 会直接关系到 是否出现 RsaI酶切位点; 且CT基因型的个体, 各方面的经 济性状均有明显提升。 因此, 利用该突变位点可 简单、 快速、 准确、 高效地检测藏鸡的经济性状, 并可直接应用到藏鸡选育中, 以提升藏鸡的经济 性能。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图1页 CN 114657268 A 2022.06.24 CN 114657268 A 1.一种影响藏鸡 性状的SNP 分子标记, 其特征在于: 所述SNP 分子标记位于藏鸡SESN2基 因对参考序列Genbank Accession No.NC_052554的第8644位点的碱基处, 突变碱基为C或 T。 2.根据权利 要求1所述的影响藏鸡性状的SNP分子标记, 其特征在于: 所述SNP 分子标记 的基因型为C C、 CT或TT中的任意 一种。 3.权利要求1或2所述SNP分子标记在检测藏鸡经济性状或藏鸡选 育中的应用。 4.包含权利要求1或2所述SNP分子标记的试剂盒 或检测试纸或检测试剂。 5.根据权利要求4所述的试剂 盒或检测试纸或检测试剂, 其特征在于: 所述试剂 盒或检 测试纸或检测试剂中至少包括用于扩增所述SNP分子标记的特异性引物对。 6.根据权利要求5所述的试剂盒或检测试纸或检测试剂, 其特征在于: 所述引物对包 括: 上游引物如SEQ ID NO: 1所示; 下游引物: 如SEQ ID NO: 2所示。 7.权利要求4~6任意一项所述试剂盒或检测试纸或检测试剂在检测藏鸡性状中的应 用。 8.根据权利要求7 所述应用, 其特 征在于: 包括如下步骤: (1)获取待检测藏鸡的血 液; (2)从血液中提取基因 组DNA; (3)将基因 组DNA进行PCR扩增, 获得PCR扩增产物; (4)将PCR扩增产物进行酶切、 电泳、 分析, 确定待测藏鸡的所述SNP分子标记的基因型。 9.根据权利 要求8所述应用, 其特征在于: 所述PCR扩增的反应体系包括: 2 ×Buffer、 扩 增所述SNP分子标记的特异性引物对、 Taq DNA聚合酶、 DNA模板 。 10.根据权利要求8所述应用, 其特征在于: 所述PCR扩增的反应程序包括: 95℃预变性 3min; 再进行36个如下循环: 94℃变性30s, 63℃退火30s, 72℃延伸30s; 循环结束后, 再72℃ 延伸5min。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114657268 A 2一种SESN2基因SNP标记检测藏鸡经 济性状的方 法及其应用 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学检测领域, 具体涉及一种SES N2基因SNP标记检测藏鸡经济 性状的方法及其应用。 背景技术 [0002]单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)是指基因组DNA序列由 于单个核苷 酸的变化而引起的多态性, 主要包括碱基的转换、 颠换、 插入和缺 失等。 SNP属于 第三代分子标记, 具有高密度、 和易于检测等优点, 已广泛应用于生物遗传多样性及分子遗 传育种研究。 [0003]分子育种, 分子标记辅助选择(molecularmark ‑assistselection, MAS), 是借助 DNA分子标记对育种材料进行选择, 进而实现对畜禽性状的品种改良。 在畜禽育种中, 如果 选出与经济性状密切相关的DNA标记, 则有望提高选种准确性, 提高选 育效率和效果。 [0004]SESN2(Hi95)是进化保守的应激诱导基因SESN家族的主要成员之一。 SESN2参与动 物代谢、 衰 老、 肌肉和神经退行性病变、 应对遗传毒性的压力、 癌症发生等生物学过程; 在 对 抗动物氧化应激反应、 阻止 肌肉萎缩和维持肌肉完整性中也具有重要作用。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种SESN2基因SNP标记检测藏鸡经济性状的方法及其应用。 [0006]为实现上述发明 目的, 本发明所采用的技术方案是: 一种影响藏鸡性状的S NP分子 标记, 所述SNP分子标记位于藏鸡SESN2基因对参考序列Genbank Accession No.NC_052554 的第8644位点的碱基处, 突变碱基为C或T。 [0007]优选的, 所述SNP分子标记的基因型为C C、 CT或TT中的任意 一种。 [0008]相应的, 所述SNP分子标记在检测藏鸡经济性状或藏鸡选 育中的应用。 [0009]相应的, 包 含所述SNP分子标记的试剂盒 或检测试纸或检测试剂。 [0010]优选的, 所述试剂盒或检测试纸或检测试剂中至少包括用于扩增所述SNP分子标 记的特异性引物对。 [0011]优选的, 所述引物对 包括: [0012]上游引物如SEQ ID NO: 1所示; 下游引物: 如SEQ ID NO: 2所示。 [0013]相应的, 所述试剂盒 或检测试纸或检测试剂在检测藏鸡性状中的应用。 [0014]优选的, 所述应用包括如下步骤: [0015](1)获取待检测藏鸡的血 液; [0016](2)从血液中提取基因 组DNA; [0017](3)将基因 组DNA进行PCR扩增, 获得PCR扩增产物; [0018](4)将PCR扩增产物进行酶切、 电泳、 分析, 确定待测 藏鸡的所述SNP分子标记的基 因型。 [0019]优选的, 所述PCR扩增的反应体系包括: 2 ×Buffer、 扩增所述SNP分子标记的特异说 明 书 1/4 页 3 CN 114657268 A 3
专利 一种SESN2基因SNP标记检测藏鸡经济性状的方法及其应用
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