(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210465977.5 (22)申请日 2022.04.29 (71)申请人 上海金域医学检验所有限公司 地址 201321 上海市浦东 新区康新公路 3377号6号楼 (72)发明人 徐玉兵　陈禹　孟晓伟　肖玲　 董沁　 (74)专利代理 机构 广州新诺专利商标事务所有 限公司 4 4100 专利代理师 李海恬 (51)Int.Cl. C12Q 1/689(2018.01) C12N 15/11(2006.01) G16B 40/20(2019.01) G16B 40/30(2019.01)C12R 1/01(2006.01) (54)发明名称 用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物及 其应用 (57)摘要 本发明涉及一种用于儿童ASD诊断的母源肠 道菌群标志物及其应用， 属于生物标志物技术领 域。 该标志物选自CAG8、 CAG10和CAG16丰度共变 化组中的至少一组菌群； 所述CAG8丰度共变化组 为具有SEQ  ID NO.1‑SEQ ID NO.12所示特征序 列的菌群； 所述CAG10丰度共变化组为具有SEQ   ID NO.13‑SEQ ID NO.17所示特征序列的菌群； 所述CAG16丰度共变化组为具有SEQ  ID NO.18‑ SEQ ID NO.22所示特征序列的菌群。 该母源肠 道 菌群标志物能够在早期诊断儿童ASD， 且具有高 灵敏度及特异性的优势。 且基因测序技术客观， 不会受到主观影响， 粪便样本具有无创、 易于运 输保存， 利于开展大规模人群 筛查。 权利要求书1页 说明书11页 序列表8页 附图6页 CN 114891904 A 2022.08.12 CN 114891904 A 1.一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 选自CAG8、 CAG10和 CAG16丰度共变化组中的至少一组菌群； 所述CAG8丰度共变化组为具有SEQ  ID NO.1‑SEQ ID NO.12所示特 征序列的菌群； 所述CAG10 丰度共变化组为具有SEQ  ID NO.13‑SEQ ID NO.17所示特征序列的菌群； 所述CAG16 丰度共变化组为具有SEQ  ID NO.18‑SEQ ID NO.22所示特征序列的菌群。 2.根据权利要求1所述的用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 所述 母源肠道菌群标志 物用于早期诊断。 3.根据权利要求1所述的用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 所述 儿童为3岁以下儿童。 4.根据权利要求1所述的用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 所述 母源肠道菌群为儿童母亲的粪便 菌群。 5.根据权利要求1所述的用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 所述 CAG8和CAG16丰度变化组的相对丰度在ASD 儿童母源肠道菌群中降低， 所述CAG10丰度变化 组的相对丰度在AS D儿童母源肠道菌群中升高。 6.根据权利要求5所述的用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物， 其特征在于， 以所 述母源肠道菌群标志 物的胃肠道 紊乱指数为儿童AS D诊断指标。 7.权利要求1 ‑6任一项所述的菌群标志物在制备用于ASD儿童诊断试剂和/或设备中的 应用。 8.一种用于ASD儿童诊断的试剂盒， 其特征在于， 包含用于检测权利要求1 ‑6任一项所 述的菌群标志 物的试剂。 9.一种用于AS D儿童诊断的系统， 其特 征在于， 包括： 数据获取模块， 用于获取待 诊断儿童母亲权利要求1 ‑6任一项所述的菌群标志 物数据； 数据分析模块， 用于分析上述菌群标志物的胃肠道紊乱指数， 与阈值进行比较， 分析得 出待诊断儿童患有AS D的风险； 结果输出模块， 用于将上述分析 结果输出。 10.根据权利 要求9所述的系统， 其特征在于， 所述阈值为 ‑1.073， 当待诊断儿童的母源 肠道菌群标志 物胃肠道 紊乱指数高于所述阈值， 则判断待 诊断儿童具有患AS D高风险。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114891904 A 2用于儿童ASD 诊断的母 源肠道菌群标志物及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物标志物技术领域， 特别是涉及一种用于儿童ASD诊断的母源肠道 菌群标志 物及其应用。 背景技术 [0002]孤独症谱系障碍(Aut ism spectrum  disorder， ASD)是一组精神发育障碍的统称， 其核心临床表现为社交损伤、 行为方式刻板和兴趣狭窄。 来自世界各地的流行病 学调查研 究显示3‑17 岁儿童ASD发病率逐年升高， 目前大约为1/50。 ASD患者生活终身难以自理， 可 能需要社会和家人长期照顾。 ASD儿童 成年后很难独立的生活和工作， 可能需要家庭和社会 终生的照顾， 给家庭带来巨大的精神痛苦和给社会 带来巨大的经济负 担。 2013年时， 在美国 和英国， 一名ASD患者一生的治疗、 护理等费用预计在140 ‑240万美元之间。 有研究预测到 2025年， 在美国这项费用将提高到450万美元左右。 然而， 目前还缺乏广泛适用的、 高效的治 疗ASD的方法。 [0003]基于ASD的早期诊断甚至超早期(2岁以下)诊断给予的早期干预对ASD的重大治疗 意义。 目前， 临床上可以使用孤独症诊断访谈量表(Autism  diagnostic  interview ‑ revised， ADI‑R) 和孤独症诊断观察量表(Autism  diagnostic observation  scale， ADOS) 等量表对3岁以上的  ASD儿童进 行明确的诊断。 然而， 利用量表的诊断手段具有一定的主观 性， 诊断结果的重复性不佳； 评估过程需要至少2名专 业人员， 并且整个评估过程可能长达4 小时以上， 占用极大的医疗成本并且评估过程中引起的疲劳也对ASD儿童具有不利影响； 不 仅如此， 还不能对  3岁以下的儿童进 行诊断。 所以， 发现具有超早期诊断能力并且适合大范 围开展AS D筛查的客观生物标志 物非常必要。 [0004]虽然目前还不明确ASD的确切病因， 但是大量的研究显示遗传因素和环境因素可 能共同在ASD的发生 发展中扮演着角色。 肠道菌群作为环 境因素之一可能与ASD的发生 发展 有关。 大量研究显示ASD儿童相对于正常发育儿童肠道菌群结构和组成显著 不同， 将正常儿 童粪便移植于ASD儿童， ASD儿童的胃肠道紊乱症状和行为异常得到有效缓解， 表明肠道菌 群组成与AS D具有因果关系。 [0005]母亲可以通过多种方式， 比如生产方式、 母乳、 皮肤接触等将自身的共生微生物传 递给子代， 这称为母源菌群的垂 直传递， 这种传递对子代肠道菌群的建立至 关重要。 已发表 的研究发现ASD儿童和其母 亲共有的肠道细菌的特征性变化与 ASD的患病程度有关， 提示肠 道菌群的垂直传递可能与AS D的发生发展 有关。 [0006]因此， 可对ASD儿童母亲的肠道菌群 组成进行研究， 寻找能够具有高灵敏度及特异 性的客观的早期筛查、 诊断AS D的母源肠道细菌标志 物。 发明内容 [0007]基于此， 有必要针对上述问题， 提供一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志 物， 该母源肠道菌群标志 物能够在早期诊断儿童AS D， 且具有高灵敏度及特异性的优势。说　明　书 1/11 页 3 CN 114891904 A 3