(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210452387.9 (22)申请日 2022.04.27 (71)申请人 普瑞基准科技 （北京） 有限公司 地址 100085 北京市海淀区上地 三街9号D 座7层D802 申请人 普瑞基准生物医药 （苏州） 有限公司 　 北京普康瑞仁医学检验所有限公司 (72)发明人 季序我　邓晨旭　韦宝耶　董宇　 (74)专利代理 机构 北京动力号知识产权代理有 限公司 1 1775 专利代理师 梁艳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变 异的试剂盒及其应用 (57)摘要 本发明提供一种用于检测或辅助检测肿瘤 相关基因变异的试剂盒及其应用， 包括成套DNA 探针， 所述成套DNA探针包括SEQ  ID NO： 1‑SEQ  ID NO： 360所示的DNA 探针。 本发明是可以检测90 基因的试剂盒 （Panel产品） ， 可一次性对目前已 经被美国食品药品监督管理局 （FDA） /国家药品 监督管理局 （NMPA） 批准上市的实体瘤靶向药物 或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行 检测。 通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样 本， 进行肿瘤含量评估、 DNA提取、 建库、 捕获、 测 序、 生物信息 学分析、 医学解读， 从而找到 可用于 指导精准治 疗的生物标志 物。 权利要求书1页 说明书16页 序列表65页 CN 114561472 A 2022.05.31 CN 114561472 A 1.一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒， 其特征在于， 包括成套DNA探 针， 所述成套DNA探针包括SEQ  ID NO： 1‑SEQ ID NO： 360所示的DNA探针。 2.根据权利要求1所述的试剂盒， 其特 征在于， 所述试剂盒还 包括杂交反应液。 3.权利要求1或2中所述的成套DNA探针。 4.权利要求1或2中所述的用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒或权利要 求3所述的成套DNA探针在 如下1)‑4） 任一种中的应用： 1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异； 2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式； 3） 预测受检者肿瘤发病风险； 4） 对肿瘤患者进行分子分型及预后指导。 5.权利要求1或2所述的用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂 盒或权利要求3 所述的成套DNA探针在制备如下1) ‑5)中任一种产品中的应用： 1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异； 2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式； 3） 辅助诊断或诊断肿瘤患者； 4） 预测受检者肿瘤发病风险； 5） 对肿瘤患者进行分子分型及预后指导。 6.根据权利要求4或5所述的应用， 其特征在于， 所述变异为点突变、 小片段插入缺失、 拷贝数变异、 基因融合和/或微 卫星不稳定性。 7.根据权利要求4或5所述的应用， 其特征在于， 所述肿瘤为子宫内膜癌、 卵巢癌、 乳腺 癌、 前列腺癌和/或胰腺癌。 8.一种检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的方法， 包括如下步骤：  (1)构建目的基因 组DNA文库；  (2)将权利要求3中所述的成套DNA探针与所述DNA文库杂交， 得到杂交产物；  (3)对所述杂交产物进行二代测序， 根据测序结果分析目的基因 组DNA的变异情况。 9.根据权利要求8所述的方法， 其特征在于， 所述肿瘤为子宫内膜癌、 卵巢癌、 乳腺癌、 前列腺癌和/或胰腺癌。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114561472 A 2一种用于 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其 应用 技术领域 [0001]本发明涉及 生物医药领域， 具体涉及一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异 的试剂盒及其应用。 背景技术 [0002]根据国家癌症中心统计， 2015年我国新发癌症病例为186.39/10万， 死亡率为 105.84/10万， 严重威胁人类健康。 临床研究将肿 瘤归为一种基因病， 主要是由于原癌基因 的激活或抑制基因的失活所导致。 随着高通量测序 （NGS） 和生物 技术的巨大进步， 已发现多 个与癌症发生发展相关的驱动基因以及可用于指导肿瘤治疗的生物标志物， 且针对驱动基 因和生物标志物开发了多款药物， 在临床治疗中可根据检测到的驱动基因突变或生物标志 物进行精准治疗， 至此肿瘤的治疗 模式从传统治疗转变为精准治疗。 [0003]现已有的可以用于精准治疗的技术手段包括S anger测序 （一代测序） 、 RT ‑PCR （荧 光定量PCR） 、 IHC （免疫组织化学法） 、 FISH （荧光原位杂交） 等。 但上述技术中都存在相应的 弊端。 例如Sanger测序， 虽然 是测序的金标准， 但由于该测序技术一个反应只能得到一条序 列， 因此测序通量低； 虽然单个反应价格低廉， 但是获得大量测序的成本高； 且检测灵敏度 较低， 一般只能检测突变丰度在20%以上的突变， 所以对于一些低频突变存在漏检的可能。 而RT‑PCR只能对已知位点进行检测， 不能发现未知位点， 不利于新靶点的探索。 IHC主要用 于检测蛋白表达， 不能检测基因的点突变 （SNV） 、 小片段插入缺失 （Indel） 等， 需要根据基因 SNV/Indel指导用药的检测不能通过IHC实现。 同理， FISH检测虽是鉴定基因融合 （Fusion） 、 扩增 （CNV） 的金 标准， 但同样不 适用SNV/I ndel的检测， 应用面存在局限。 发明内容 [0004]本发明要解决的技术问题在于克服Sanger测序 （一代测序） 、 RT ‑PCR （荧光定量 PCR） 、 IHC （免疫组织化学法） 、 FISH （荧光原位杂交） 技术中检测基因变异的缺陷， 从而提供 一种用于准确检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用。 [0005]本发明提供一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒， 包括成套DNA 探针， 所述成套DNA探针包括SEQ  ID NO： 1‑SEQ ID NO： 360所示的DNA探针。 [0006]优选的， 所述试剂盒还 包括杂交反应液。 [0007]杂交反应液包括xGen  ® 2x Hybridization  Buffer和xGen  ® 2x Hyb Buffer  Enhancer。 [0008]成套探针包括SEQ  ID NO： 1‑SEQ ID NO： 360所示的DNA探针等摩尔混合。 [0009]上述的成套DNA探针。 [0010]上述用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒或上述的成套DNA探针在如 下1)‑5） 任一种中的应用： 1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异；说　明　书 1/16 页 3 CN 114561472 A 3