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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210440506.9 (22)申请日 2022.04.25 (71)申请人 南昌大学第一附属医院 地址 330006 江西省南昌市永外正 街17号 (72)发明人 张伟 刘洋 许恒毅 邓梅 徐倩 熊琴 孔蕴源 程南燕 牟丹 (74)专利代理 机构 北京慕达星云知识产权代理 事务所 (特殊普通合伙) 11465 专利代理师 魏志恒 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6844(2018.01) C12Q 1/6806(2018.01) C12N 15/11(2006.01)C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 一种新型冠状病毒检测试剂盒及基于磁珠 富集结合RPA的检测方法 (57)摘要 本发明公开了一种新型冠状病毒检测试剂 盒及基于磁珠富集结合RPA的检测方法, 涉及病 毒检测技术领域。 具体通过硅基磁珠实现对目标 病毒核酸的提取, 进一步进行 RPA反应, 得到大量 的核酸, 最后通过荧光检测, 实现对新型冠状病 毒COVID‑19的检测。 本发明检测方法具有方便、 特异性强、 灵 敏度高的优点, 与RT ‑PCR相比, 大大 缩短了检测时间, 实现高效快速检测新型冠状病 毒的目的。 权利要求书2页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 114686621 A 2022.07.01 CN 114686621 A 1.一种新型 冠状病毒检测试剂盒, 其特 征在于, 包括以下引物对和探针: 上游引物F: 5 ’ ‑CCTCTTCTCGTTCCTCATCACGTAGTCGCA AC‑3’, SEQ ID NO.1; 下游引物R: 5 ’ ‑AGTGACAGT TTGGCCTTGTTGTTGTTGGCCTT‑3’, SEQ ID NO.2; 探针P: 5’ ‑TAGAATGGCTGGCAATGGCGGTGATGCTGCT TGCTTTGCTGCTGCT T‑3’, SEQ ID NO.3, 所述探针P采用荧光淬灭基团和荧光报告基团进行修饰, 荧光淬灭基团修饰在探针序 列离5’端碱基数28bp的位置上; 荧光报告基团修饰在探针序列离5 ’端碱基数33bp的位置 上, 荧光淬灭基团与报告基团之间间隔4个碱基GCTT, 其中离5 ’端碱基数30bp的位置上的C 用四氢呋喃残基替换; 3 ’端采用磷酸盐修饰用以阻断链的延伸。 2.根据权利要求1所述的试剂盒, 其特 征在于, 还 包括: Buf fer C、 Buffer D和ddH2O; 所述Buffer C为50mM Tris pH 8.4、 80mM乙酸钾、 2mM DTT、 3mM ATP、 200μM dNTPs、 20mM磷酸肌酸、 10 0ng/ μL肌酸激酶和5%聚乙二醇20 M; 所述Buffer D为20mM乙酸镁。 3.根据权利要求2所述的试剂盒, 其特征在于, 总体积50μL, 包括2μL上游引 物F、 2μL下 游引物R、 0.6 μL探针P、 2 9.4 μL Buffer C、 2.5 μL Buffer D、 ddH2O和模板13.5 μL; 且, 所述上游引物F、 下游引物R和探针P的浓度均为10 μM 。 4.一种基于磁珠富集结合RPA 的非诊断治疗目的的新型冠状病毒检测方法, 其特征在 于, 利用权利要求1 ‑3任一所述的试剂盒。 5.根据权利要求 4所述的检测方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: (1)富集核酸: 采集样本, 加入离心管中, 再加入BufferA和硅基磁珠, 置于混匀仪上混 匀3min, 静置5‑10min, 离心后, 磁分离 3min后去上清; 再加入Buf fer B, 置于混匀仪上混匀后, 磁分离 3min后去上清液; 再加入Wash Buffer, 置于混匀仪上混匀, 磁分离1mi n后去上清液; 离心管于20~ 25℃敞口放置10 ‑15min; 往离心管中加入20 μL ddH2O重悬, 于混匀仪上混匀, 离心将反应液甩至管底后, 于65℃ 水浴10mi n, 磁分离 30s, 得到纯化的核酸模板; (2)RPA检测: 向干粉反应管中加入Buffer C; 然后加入上游引物F、 下游引物R和探针P; 再依次加入ddH2O和步骤(1)所得核酸模板; 最后加入Buffer D, 上下颠倒甩动反应管进行 混匀; 离心将反应液 甩至管底, 立即放入荧 光检测设备中, 42℃反应20mi n, 采集并分析 结果。 6.根据权利要求5所述的检测方法, 其特征在于, 所述Buffer A为118.16g异硫氰酸胍 盐、 0.2M EDTA pH 8.0和100mL 0.1M Tris‑HCl pH 6.5; Buffer B为1.477g异硫氰酸胍盐、 100mL 0.1M Tris‑HCl pH 7.5和150mL无水乙醇; Wash Buffer为乙醇, 浓度为70%vo l; Buffer C为50mM Tris pH 8.4、 80mM乙酸钾、 2mM DTT、 3mM ATP、 200 μM dNTPs、 20mM磷 酸肌酸、 10 0ng/ μL肌酸激酶和5%聚乙二醇20 M; Buffer D为20mM乙酸镁。 7.根据权利要求5所述的检测方法, 其特征在于, 步骤(1)所述硅基磁珠表面修饰硅羟 基, 且粒径大于1 μm。 8.根据权利要求5所述的检测方法, 其特征在于, 步骤(1)所述磁分离的磁场强度为权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114686621 A 20.4T。 9.根据权利要求5所述的检测方法, 其特征在于, 步骤(2)所述Buffer C添加量29.4 μL, 所述上游引物F添加量2 μL、 所述下游引物R添加 量2 μL、 所述探针P添加 量0.6μL, 所述ddH2O 添加量11.5 μL, 所述核酸模板添加量2 μL, 所述Buf fer D添加量2.5 μL, 且, 所述上游引物F, 所述下游引物R和所述探针P的浓度为10 μM 。 10.根据权利 要求5所述的检测方法, 其特征在于, 步骤(2)采集的是475nm的荧光值, 且 每隔30s采集一次。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114686621 A 3
专利 一种新型冠状病毒检测试剂盒及基于磁珠富集结合RPA的检测方法
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