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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210427634.X (22)申请日 2022.04.22 (71)申请人 佛山科学技术学院 地址 528000 广东省佛山市禅城区江湾一 路18号 (72)发明人 郭銮英 卢浩彤 金咤 陈美伊  刘全  (74)专利代理 机构 广州新诺专利商标事务所有 限公司 4 4100 专利代理师 刘婉 林玉芳 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6848(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 用于检测广东蜱夸兰菲尔病毒的引物对、 检 测试剂盒及巢式PCR检测方法 (57)摘要 本发明公开了一种用于同时检测广东蜱夸 兰菲尔病毒三个基因的引物对, 所述引物对包括 一条上游引物和一条下游引物, 所述上游引物的 核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示, 所述下游引 物 的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2所示。 本发明还提 供了一种检测试剂盒, 其包括所述引物对。 本发 明还提供了一种同时检测广东蜱夸兰菲尔病毒 三个基因的巢式PCR检测方法, 该方法包括以下 步骤: 1)提取携带广东 蜱夸兰菲尔病毒的蜱的样 品RNA; 2)设计并合成PCR引物对; 3)以样品RNA为 模板, 进行巢式PCR扩增; 4)将PCR产物进行琼脂 糖凝胶电泳检测。 本发明可以同时扩增GT QV三个 不同功能基因, 一条电泳道能同时呈现三条长度 不同、 清晰不重合的特异性条带, 实现一引物多 功能的高效检测。 权利要求书1页 说明书15页 序列表7页 附图1页 CN 115109869 A 2022.09.27 CN 115109869 A 1.一种用于同时检测广东蜱夸兰菲尔病毒三个基因 的引物对, 所述引物对包括一条上 游引物和一条下游引物, 其特征在于, 所述上游引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示, 所 述下游引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2所示。 2.一种检测试剂盒, 其包括权利要求1所述的用于同时检测广东蜱夸兰菲尔病毒三个 基因的引物对。 3.一种同时检测广东蜱夸兰菲尔病毒三个基因的巢式PCR检测方法, 所述方法包括以 下步骤: 1)提取携带广东蜱夸兰菲尔病毒的蜱的样品RNA; 2)设计并合成PCR引物对, 所述引物对包括一条上游引物和一条下游引物, 所述上游引 物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示, 所述下游引物的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2所示; 3)以样品RNA为模板, 进行巢式PCR扩增; 4)将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。 4.根据权利 要求3所述的方法, 其特征在于, 步骤3)中的巢式PCR扩增包括第一轮PCR反 应和第二轮PCR反应, 两轮PCR反应均使用步骤2)中的PCR引物对进行扩增。 5.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述第一轮PCR反应的反应体系为: RNase ‑ Free dH2O 3.4μL, 2 ×1 Step Buffer 5.0μL, 上游引物0.5μL, 下游引物0.5μL, PrimeScript  Enzyme 0.3 μL, 待检样品RNA  0.3 μL, 总共10 μL。 6.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述第一轮PCR反应的反应条件为: 50℃   30min; 94℃ 2min; 94℃ 30s, 50℃ 30s, 72℃ 1min 30s, 30个循环; 72℃  5min, 4℃保温。 7.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述第二轮PCR反应的反应体系为: RNase ‑ Free dH2O 3 μL, Premix  Taq 5 μL, 上游引物0.5 μL, 下游引物0.5 μL, 第一轮PCR反应产物1μ L, 总共10 μL。 8.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述第二轮PCR反应的反应条件为: 98℃   1min; 98℃ 30s, 50℃ 30s, 72℃ 1min 30s, 30个循环; 72℃  5min, 4℃保温。 9.根据权利要求3所述的方法, 其特征在于, 所述上游引物和所述下游引物的浓度均为 10 μM。 10.根据权利要求3所述的方法, 其特 征在于, 所述样品RNA终浓度为20 0ng/ μL。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115109869 A 2用于检测广东蜱夸兰菲尔病毒 的引物对、 检测试剂盒及 巢式 PCR检测方 法 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学领域, 具体涉及一种用于检测广东蜱夸兰菲尔病毒的引物 对、 包 括其的检测试剂盒以及巢式PCR检测方法。 背景技术 [0002]正粘病毒科(Orthomyxoviridae)包含7个病毒属, 分别为A型流感病毒、 B型流感病 毒、 C型流感病毒、 D型流感病毒、 托高土病毒属(Thogotovirus)、 夸兰菲尔病毒属 (Quaranfilvirus)  和传染性鲑鱼贫血病毒属(Isavirus)。 该科病毒感染宿主范围广, 包括 人、 鸟、 猪、 鱼和节  肢动物等。 传播途径也较多样, 包括粪便、 口腔、 水、 空气和直接接触等。 正粘病毒代表种  为A型禽流 感病毒, 禽流 感病毒主要通过口腔途径、 呼吸道途径、 气溶胶或 飞沫途径以及直  接接触感染人和禽类; B型流感病毒和C型流感病毒主要通过呼吸道传播 给人和哺乳动物;  传染性鲑鱼贫血病毒属目前只有一个种, 通过水源传播给鱼类; 托高土 病毒属主要通过蜱虫  感染哺乳动物; 夸兰菲尔病毒属是2011年新增的属, 目前病毒及参考 文献较少, 该属的病毒  主要是在禽类及蜱虫中发现的。 [0003]蜱传正粘病毒多为托高土病毒属和夸兰 菲尔病毒属病毒。 夸兰菲尔病毒属已知的 蜱媒病 毒有夸兰菲尔病毒(Quaranfilvirus, QRFV)和约翰斯登环状珊瑚岛病毒(John ston  Atoll virus, JAV)。 QRFV最初是从1953年埃及夸兰菲尔地区锐缘蜱属蜱类体内分离出来 的。 QRFV尚  无感染人的确切报道, 但有研究显示人群血清中有该病毒的特异性抗体存在 (J‑D Converse,  Moussa M‑I.Quaranfil  virus from Hyalomma  dromedarii(Acari: Ixodoidea)collected  in Kuwait, Iraq and Yemen[J].J  Med Entomol,1982,19(2): 209‑210.)。 JAV最早于1964年从中太平洋约  翰斯登环状珊瑚岛上的好望角钝缘蜱体内分 离出来, 该病毒目前亦无致人患病报道。 1966年  有文献报道, 在2名轻微发热最 终康复的幼 童血液中发现Q RFV, 虽然这些发现不能证明儿  童的疾病是由QRFV引起的, 但可能表明至少 有一种QRFV可以感染人类(F ‑J Austin.Johnston Atoll  virus(Quaranfil  group)from   Ornithodoros  capensis(Ixodoidea:Argasidae)infesting  a gannet colony  in New  Zealand[J].Am  J Trop Med Hyg,1978,27(5):1045 ‑1048.)。 这一事实也突显了监  测和诊 断蜱传新发病的重要性。 [0004]QRFV有6个节段, 分别编码聚合酶蛋白polymerase  basic 1protein(PB1)、 polymerase basic  2protein(PB2)、 pol ymerase acidic protein(PA); 外层蛋白的血球凝 集素蛋白h emagglutinin p rotein(HA)、 膜蛋白matrix  protein(M); 核蛋白nucleoprotein (NP)。 [0005]本研究前期通过宏转录组高通量测 序技术, 在广东省揭阳市的牛身上的微小牛蜱 中发现 了正粘病毒科、 夸兰菲尔病毒属的新种。 通过反转录 ‑巢式PCR及RACE末端序列扩增 方法, 获得该正粘病毒的全基因组(Genbank登录号为OM273643~OM273648), 该病毒与最 相近 的正粘病毒氨基酸同源性仅为57%~89.3%, 根据本实验室对该病毒基因序列同源说 明 书 1/15 页 3 CN 115109869 A 3

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