(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210420064.1 (22)申请日 2022.04.21 (71)申请人 河南七度农业科技有限公司 地址 450000 河南省郑州市惠济区南阳路 177号昌建誉峰15号楼190 5 申请人 北京博纳东方农业科技发展 有限公 司　 北京中研益农种苗科技有限公司 　 河南农业大 学 (72)发明人 李纪锁　贾芝琪　康东木　贾明朝　 张砚迪　李营　 (74)专利代理 机构 郑州三阳专利代理事务所 (普通合伙) 41175 专利代理师 袁宏伦(51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6874(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种番茄全基因组芯片及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种番茄全基因组芯片及其 应用， 发现及筛选出可用于芯片设计的基因分型 对象包括定位于番茄参考基因组SL2.50上的 1377个SNP位点和80个Indel位点， 利用液相芯片 可以通过靶向捕获测序技术实现番茄基因分型； 通过实验结果表明， 本发明设计的芯片可用于番 茄遗传多样性分析、 品种鉴定、 亲缘关系鉴定、 全 基因组关联分析以及基因 组选择育种。 权利要求书4页 说明书6页 附图2页 CN 114736985 A 2022.07.12 CN 114736985 A 1.一种番茄全基因组芯片， 其特征在于， 该芯片的基因分型对象包括定位于番茄参考 基因组SL2.50上的1377个SNP位点和80个Indel位点； 这些SNP位点和Indel位点在参考基因 组的分子标记位 点包括： SL2.50ch01_1124825； SL2.50ch01_1125796； SL2.50ch01_1677737； SL2.50ch01_ 2078506； SL2.50ch01_3973295； SL2.50ch01_3974505； SL2.50ch02_34285108； SL2.50ch02_ 34285162； SL2.50ch03_64540483； SL2.50ch04_1813305； SL2.50ch04_1813331； SL2.50ch04_39555167； SL2.50ch05_6381569； SL2.50ch05_6404126； SL2.50ch06_2161990； SL2.50ch06_2162280； SL2.50ch06_2163925； SL2.50ch06_2354841； SL2.50ch06_34370002； SL2.50ch06_34370158； SL2.50ch06_34389411； SL2.50ch06_34389561； SL2.50ch06_ 35009157； SL2.50ch06_35009202； SL2.50ch06_35009232； SL2.50ch06_35009237； SL2.50ch06_35009245； SL2.50ch06_35009250； SL2.50ch06_35009260； SL2.50ch06_ 35009272； SL2.50ch06_35950028； SL2.50ch06_37186202； SL2.50ch07_63597481； SL2.50ch08_61642121； SL2.50ch09_56697； SL2.50ch09_57025； SL2.50ch09_4943007； SL2.50ch09_5090186； SL2.50ch09_13621583； SL2.50ch09_13621676； SL2.50ch09_ 13621682； SL2.50ch09_13621846； SL2.50ch09_71434430； SL2.50ch09_71436208； SL2.50ch09_72029144； SL2.50ch09_72029219； SL2.50ch09_72032340； SL2.50ch09_ 72032691； SL2.50ch11_9317442； SL2.50ch11_54264376； SL2.50ch11_54531455； SL2.50ch11_54531515； SL2.50ch11_54897353； SL2.50ch11_54913693； SL2.50ch11_ 55071011； SL2.50ch11_55299325； SL2.50ch12_2941301； SL2.50ch12_3809589； SL2.50ch12_4543132； SL2.50ch01_78745063； SL2.50ch01_78747579； SL2.50ch01_78747639； SL2.50ch01_ 78747668； SL2.50ch01_78747838； SL2.50ch01_78911282； SL2.50ch01_82203699； SL2.50ch01_82205102； SL2.50ch01_82207046； SL2.50ch02_45196896； SL2.50ch03_ 52152865； SL2.50ch03_52152879； SL2.50ch03_52152905； SL2.50ch03_52153104； SL2.50ch03_52153202； SL2.50ch03_52153309； SL2.50ch03_52153473； SL2.50ch03_ 52153858； SL2.50ch03_52154291； SL2.50ch03_52154481； SL2.50ch03_52154565； SL2.50ch03_52154574； SL2.50ch03_52154673； SL2.50ch03_52154825； SL2.50ch03_ 52155769； SL2.50ch03_52180873； SL2.50ch03_52182577； SL2.50ch03_52386476； SL2.50ch03_52406077； SL2.50ch03_65751759； SL2.50ch05_8998720； SL2.50ch05_ 9313748； SL2.50ch01_40124913； SL2.50ch01_53317722； SL2.50ch01_72488048； SL2.50ch01_ 77558637； SL2.50ch01_98247086； SL2.50ch02_29935554； SL2.50ch02_44944551； SL2.50ch04_978312； SL2.50ch04_4834961； SL2.50ch04_9633653； SL2.50ch04_53335117； SL2.50ch05_44420698； SL2.50ch05_54497816； SL2.50ch06_15767679； SL2.50ch06_ 37444105； SL2.50ch08_1381293； SL2.50ch08_23948349； SL2.50ch08_28887544； SL2.50ch08_44832241； SL2.50ch08_45610138； SL2.50ch08_49276668； SL2.50ch08_ 57714845； SL2.50ch08_58664027； SL2.50ch08_60599653； SL2.50ch08_61583858； SL2.50ch08_62573296； SL2.50ch08_63731190； SL2.50ch08_64621335； SL2.50ch08_ 65360761； SL2.50ch09_1468885； SL2.50ch09_5365363； SL2.50ch09_15147765；权　利　要　求　书 1/4 页 2 CN 114736985 A 2SL2.50ch09_37706150； SL2.50ch09_42531761； SL2.50ch10_10257147； SL2.50ch11_ 500493； SL2.50ch11_2795604； SL2.50ch11_4360855； SL2.50ch11_7764094； SL2.50ch11_ 8090264； SL2.50ch11_829778 7； SL2.50ch11_8 705537； SL2.50ch11_8 764030； SL2.50ch11_ 8885924； SL2.50ch11_8990978； SL2.50ch11_927398 7； SL2.50ch11_9679304； SL2.50ch11_ 9825111； SL2.50ch11_51503295； SL2.50ch11_55107953； SL2.50ch01_21006695； SL2.50ch01_97390074； SL2.50ch08_21514991； SL2.50ch08_21935647； SL2.50ch08_ 30124360； SL2.50ch08_33554881； SL2.50ch08_33572491； SL2.50ch08_38712700； SL2.50ch08_50888332； SL2.50ch08_51018195； SL2.50ch08_54478887； SL2.50ch08_ 56039111； SL2.50ch08_57456680； SL2.