(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 202210390874.7 (22)申请日 2022.04.14 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114807384 A (43)申请公布日 2022.07.29 (73)专利权人 华南农业大 学 地址 510642 广东省广州市天河区华 南农 业大学 (72)发明人 张细权　符蓉　梁佳莹　任团辉　 李王钰　李秋梅　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 有限公司 1 1562 专利代理师 张换君 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (56)对比文件 CN 109182542 A,2019.01.1 1 CN 113913538 A,202 2.01.11CN 1082515 39 A,2018.07.0 6 WO 2010017670 A1,2010.02.18 US 2006037090 A1,20 06.02.16 WO 0069882 A1,20 00.11.23 US 2013012401 A1,2013.01.10 Guang-Qi Gao 等.xpres sion levels of GSTA2 and APOD genes might be as sociated with caroten oid coloration in golden pheasant (C hrysolophus pictus) pluma ge. 《Dongwuxue Yanjiu》 .2016,第37 卷(第3期), null.rs733222209. 《ensembl》 .2021, Tuanhui Ren 等.A 31-bp i ndel in the 5′ UTR region of GNB1L is sign ificantly associated w ith chicken body weight and carcass traits. 《BM C Genet》 .2020,第21卷 null.rs15970738. 《ensembl》 .2021, 李王钰 等.鸡GSTA 2基因5′UTR区域变异及 其与重要经济性状关联性. 《中国家禽》 .2021,第 43卷(第4期), 审查员 颜泉梅 (54)发明名称 一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其 应用 (57)摘要 本发明公开了一种 与鸡屠体性状相关的SNP 分子标记及其应用， 属于分子生物 技术和分子标 记技术领域。 本发明公开一种与鸡屠体性状相关 的SNP分子 标记， 其核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所 示。 本发明实验结果显示： 本发明的SNP分子标 记， 位于鸡9号染色体APOD基因5 ‘‑侧翼区基因序 列中的突变位点g.12360333G>T和g.12360387T> C， 与鸡胫爪重和心肝肌胃腺胃重性状相关， 是新 的分子标记。 通过优选 该SNP位点的优势 基因型， 对鸡屠体性状进行早期选择， 不仅可以节省生产 成本， 还能加快遗传进展， 将其应用于鸡的育种 中， 具有很大的经济 应用价值。 权利要求书1页 说明书6页 序列表1页 附图2页 CN 114807384 B 2022.11.25 CN 114807384 B 1.一种利用与鸡屠体性状相关的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法， 其特征在 于， 利用所述SNP分子标记早期筛选鸡的胫爪重和心肝肌胃腺胃重性状的过程， 所述SNP分 子标记的突变位点为鸡基因组参考序列第12360333bp处的G>T突变， 所述鸡基因组参考序 列的登录号为NC_052540.1， 其中， SNP突变位点的基因型包括GG、 GT和TT， GG基因型个体表 现出最高的胫爪重和心 肝肌胃腺胃重， TT基因型个体表现出最低的胫爪重和心 肝肌胃腺胃 重， 所述鸡为 杏花鸡×隐性白洛克鸡全同胞 F2资源群。 2.一种利用与鸡屠体性状相关的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法， 其特征在 于， 包括利用所述SNP分子标记早期筛选鸡的胫爪重和心肝肌胃腺胃重性状的过程， 所述 SNP分子标记的突变位点为鸡基因组参考序列第12360387bp处的T>C突变， 所述鸡基因组参 考序列的登录号为NC_052540.1， 其中， SNP突变位点的基因型包括TT、 TC和CC， TT基因型个 体表现出最高的胫爪重和心 肝肌胃腺胃重， CC基因型个体表现出最低的胫爪重和心肝肌胃 腺胃重， 所述屠体性状是胫爪重和心肝肌 胃腺胃重， 所述鸡为杏花鸡 ×隐性白洛克鸡全同 胞F2资源群。 3.根据权利 要求1或2所述的方法， 其特征在于， 利用PCR扩增检测权利要求1或2中所述 的SNP分子标记。 4.根据权利要求3所述的方法， 其特征在于， 所述PCR所用到的扩增引物为： F： TTGAGCACACTGAG GGTC； R： CGTACTG GTGGGAAACAGA。 5.根据权利要求4所述的方法， 其特征在于， 所述PCR扩增体系包括： PCR  混合液5.0 μL， 两条引物各0.3 μL， DNA  1.0 μL和水3.4 μL。 6.根据权利要求3所述的方法， 其特征在于， 所述PCR扩增程序包括： 98℃预变性5min， 98℃变性5s， 58℃退火10s， 72℃延伸10s， 72℃后延伸5mi n， 4℃保存， 共34个 循环。 7.检测与鸡屠体性状相关的SNP分子标记的试剂在筛选鸡屠体性状中的应用， 其特征 在于， 所述SNP分子标记的突变位点为鸡基因组参考序列第12360333bp处的G>T突变， 所述 鸡基因组参考序列的登录号为NC_052540.1， 其中， SNP突变位点的基因型包括GG、 GT和TT， GG基因型个体表现出最高的胫爪重和心 肝肌胃腺胃重， TT基因型个体表现出最低的胫爪重 和心肝肌 胃腺胃重， 所述屠体性状是胫爪重和心肝肌 胃腺胃重， 所述鸡为杏花鸡 ×隐性白 洛克鸡全同胞 F2资源群。 8.检测与鸡屠体性状相关的SNP分子标记的试剂在筛选鸡屠体性状中的应用， 其特征 在于， 所述SNP分子标记的突变位点为鸡基因组参考序列第12360387bp处的T>C突变， 所述 鸡基因组参考序列的登录号为NC_052540.1， 其中， SNP突变位点的基因型包括TT、 TC和CC， TT基因型个体表现出最高的胫爪重和心 肝肌胃腺胃重， CC基因型个体表现出最低的胫爪重 和心肝肌 胃腺胃重， 所述屠体性状是胫爪重和心肝肌 胃腺胃重， 所述鸡为杏花鸡 ×隐性白 洛克鸡全同胞 F2资源群。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114807384 B 2一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子生物技术和分子标记技术领域， 特别是涉及一种与鸡屠体性状相 关的SNP分子标记及其应用。 背景技术 [0002]ApoD是一种独特的载脂蛋白， 1963年， ApoD在人血浆中首次被 发现， 最初 被确定为 高密度脂蛋白的一个组成部分， 1973年首次从人血浆中分离出来， 随后被证明是脂质运载 蛋白家族的一员。 ApoD不像其他载脂蛋白主要产生于血浆中， 它主要存在于高密度脂蛋白 (HDL)中， 在极低密度脂蛋白(VLDL)中较少。 ApoD可以结合胆固醇、 孕酮、 孕烯醇酮、 胆红素 和花生四烯酸。 目前已经在人类、 猴子、 猪、 兔、 大鼠、 小鼠和鸡等几种脊椎动物中鉴定出 ApoD。 研究指出， APOD基因在胚胎和成体的生长、 发育和分化、 肿瘤细胞的发生、 发展和凋 亡、 抵抗外界环境胁迫、 维护机体脂质稳态平衡以及在一些神经系统的发生、 损伤修复以及 紊乱和疾病中发挥重要作用。 [0003]目前， 在脊椎动物和人的研究中都已确定APOD基因与脂蛋白代谢有关。 研究发现 APOD与阿尔茨海默氏病(AD)和帕金森的发病机理有关。 在动物研 究中， 发现APOD对家蚕的 蜕皮调控机制有影响； 2005年， 发现鸡APOD  mRNA在皮肤中表达是心脏中的246.48到38.44 倍； 研究报道APOD基因是鸟类胡萝卜素着色的候选基因； 此外， 还发现APOD在鸡羽毛发育中 有表达。 关于APOD基因与鸡屠体性状间的关系， 目前还很少报道。 [0004]随着人们生活水平的不断提高， 人们对于肉品质的需求也逐渐提高。 因此， 寻找新 的途径来 提高鸡的屠体性能， 并使其稳定 遗传是至关重要的。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种鸡屠体性状相关的APOD基因分子标记和应用， 以解决上 述问题。 利用APOD基因分子标记筛选鸡屠体性状， 不仅可以节省生产成本、 加快遗传进展， 更好地应用于鸡的育种中， 还具有经济应用价 值和科研价 值。 [0006]为实现上述目的， 本发明提供了如下 方案： [0007]技术方案一： 一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记， 所述SNP分子标记的核苷酸 序列如SEQ  ID NO.1所示。 [0008]进一步地， 所述SNP分子标记的突变位 点的基因型包括G G、 GT、 TT、 TC和CC； [0009]进一步地， 所述SNP分子标记的突变位点为鸡基因组9号染色体上第12360333bp处 的G>T突