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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210382857.9 (22)申请日 2022.04.13 (71)申请人 深圳荻硕贝肯 精准医学有限公司 地址 518000 广东省深圳市大鹏新区葵涌 街道生命科 学产业园A17栋2 楼 (72)发明人 郑仲征 杜可明 徐祥 王思谕 袁志阳 (74)专利代理 机构 深圳华企汇 专利代理有限公 司 44735 专利代理师 谢伟 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于检测HLA-A02基因的引物探针组、 试剂盒及检测方法 (57)摘要 本发明公开了一种用于检测HLA ‑A02基因的 引物探针组、 试剂盒及检测方法; 其中, 引物探针 组包括核苷酸如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.6所 示的HLA‑A02特异性引物和HLA ‑A02特异性探针; HLA‑A02基因的检测方法是采用试剂盒检测HLA ‑ A02, 基于TaqMan ®探针PCR技术来实现的, 具有 很高的特异性; 同时, 该方法通过合理的引物和 探针搭配, 有效避免引物与引物之间、 引物与探 针之间, 以及探针与探针之间的相互作用, 提高 了HLA‑A02检测的特异性, 有效避免了假阳性。 权利要求书2页 说明书6页 附图3页 CN 114457165 A 2022.05.10 CN 114457165 A 1.一种用于检测HLA ‑A02基因的引物探针组, 其特征在于, 包括核苷酸如SEQ ID NO.1 至 SEQ ID NO.6所示的HLA ‑A02特异性引物和HLA ‑A02特异性探针; 其中, 所述核苷酸如SEQ ID NO.1至 SEQ ID NO.6所示的引物探针组如下: 上游引物SEQ ID NO.1:5'‑TCCTCGTCCCCAGGCACT‑3'; 下游引物SEQ ID NO.2: 5'‑GAACTGCGTGTCGTC CACG‑3'; 上游引物SEQ ID NO.3: 5'‑CGGGAACCTCCTGGACTACC‑3'; 下游引物SEQ ID NO.4: 5'‑CATGGCTGACGAGATCTGAGTG ‑3'; 探针SEQ ID NO.5: FAM‑CCGCTTCATCGCAGTG ‑MGB; 探针SEQ ID NO.6: VIC‑CAGCAGCAC CACGGCGTTCACC‑BHQ1。 2.根据权利要求1所述的引物探针组, 其特征在于, 所述引物探针组中含有HLA ‑A02基 因和ABL1管家基因。 3.根据权利要求1所述的引物探针组, 其特征在于, 所述引物探针组中,荧光定量PCR探 针的5’端有FAM或VIC修饰及荧 光定量PCR探针的3 ’端有NFQ‑MGB或BHQ1修饰。 4.一种试剂盒, 其特征在于, 该试剂盒包括权利 要求1至3任一所述用于检测HLA ‑A02基 因的引物探针组。 5.根据权利要求4所述的试剂 盒, 其特征在于, 所述试剂 盒还包括阳性対照液和空白对 照液; 其中, 所述阳性対照液中含有质粒DNA; 所述空白对照为TE缓冲液; 所述阳性対照液中 加入有起保护质粒DNA作用的carrier RNA溶液, 且所述carrier RNA溶液的终浓度为10~ 50ng/ μL。 6.根据权利要求5所述的试剂盒, 其特征在于, 所述质粒DNA中含有HLA ‑A02基因和ABL1 管家基因。 7.一种检测HLA ‑A02基因方面的检测方法, 用于非疾病诊断目的, 包括如下步骤: 获取抽提的待测样本基因 组DNA; 在同一荧光PCR扩增的反应体系中, 将待测样本基因组DNA与核苷酸如SEQ ID NO.1至 SEQ ID NO.6所示的引物探针组的HLA ‑A02特异性引物和HLA ‑A02特异性探针按照确定比例 进行混合; 以所述待检测样本基因 组DNA为模板, 进行荧 光PCR扩增, 并收集 荧光信号; 荧光信号收集结束后, 导出数据 结果并进行分析, 判断所述检测样品基因组DNA中是否 携带HLA‑A02基因; 其中, 所述核苷酸如SEQ ID NO.1至 SEQ ID NO.6所示的引物探针组如下: 上游引物SEQ ID NO.1:5'‑TCCTCGTCCCCAGGCACT‑3'; 下游引物SEQ ID NO.2: 5'‑GAACTGCGTGTCGTC CACG‑3'; 上游引物SEQ ID NO.3: 5'‑CGGGAACCTCCTGGACTACC‑3'; 下游引物SEQ ID NO.4: 5'‑CATGGCTGACGAGATCTGAGTG ‑3'; 探针SEQ ID NO.5: FAM‑CCGCTTCATCGCAGTG ‑MGB; 探针SEQ ID NO.6: VIC‑CAGCAGCAC CACGGCGTTCACC‑BHQ1。 8.根据权利要求7所述的检测方法, 其特征在于, 所述待测样本基因组DNA中, 稀释后 DNA终浓度至1ng/μL~5ng/μL, 所述荧光PCR扩增的反应体系中, 还包括组分TaqMan FAST advance Master Mix和超纯 水。 9.根据权利要求8所述的检测方法, 其特征在于, 所述荧光PCR扩增反应体系为10μL总权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114457165 A 2反应体系; 其中, 包括5 μL的TaqMan FAST advance Master Mix, 上游引物SEQ ID NO.1和下 游引物SEQ ID NO.2各400nM, 上游引物SEQ ID NO.3和下游引物SEQ ID NO.4各300nM, 探针 SEQ ID NO.5和探针SEQ ID NO.6各20 0nM, 1ng~20ng的基因 组DNA, 其 余用超纯 水补齐。 10.根据权利要求9所述的检测方法, 其特征在于, 所述荧光PCR扩增的反应体系, 不同 阶段的反应条件如下: 预变性处 理: 50℃下预处理2分钟; 变性处理: 95℃下 预变性5分钟; 降落PCR: 95℃预变性15秒, 65℃起, 每 隔一个循环降低0.5℃进行退火10秒; 然后72℃ 下延伸20秒; 持续执 行10个循环; 延伸处理: 95℃预变性15秒, 6 0℃下退火30秒, 收集 荧光信号; 持续执 行30个循环。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114457165 A 3
专利 一种用于检测HLA-A02基因的引物探针组、试剂盒及检测方法
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