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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210362001.5 (22)申请日 2022.04.07 (71)申请人 领航基因科技 (杭州) 有限公司 地址 310000 浙江省杭州市萧 山区南阳街 道横蓬园区红山工业区 (72)发明人 夏江 高学娟  (74)专利代理 机构 杭州汇和信专利代理有限公 司 33475 专利代理师 薛文玲 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/686(2018.01) C12R 1/645(2006.01) C12R 1/66(2006.01) (54)发明名称 尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引物 探针及其应用 (57)摘要 本发明提供一种尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引物探针及其应用, 提供了针对检测 尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引物探针, 且这些引物探针针对尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的ITS的特异性区域设计, 可结合数字 PCR技术快速实现尖端 赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢 曲霉的快速 检测。 权利要求书1页 说明书9页 序列表3页 CN 114908084 A 2022.08.16 CN 114908084 A 1.检测尖端赛多孢子菌的引物探针, 其特征在于, 包括: SEQ  ID NO 1~2所示的核苷酸 序列的引物和SEQ  ID NO:3所示核苷酸序列的探针。 2.根据权利要求1所述的尖端赛多孢子菌的引 物探针, 其特征在于, SEQ  ID NO: 3所示 的探针的5 ’端标记有荧 光报告基团FAM, 3端标记有荧 光淬灭基团MGB。 3.检测土曲霉的引物探针, 其特征在于, 包括: SEQ  ID NO 4~5所示的核苷酸序列的引 物和SEQ ID NO:6所示核苷酸序列的探针。 4.检测根据权利要求3所述的土曲霉的引物探针, 其特征在于, SEQ  ID NO: 6所示的探 针的5’端标记有荧 光报告基团ROX, 3端标记有荧 光淬灭基团MGB。 5.构巢曲霉的引物探针, 其特征在于, 包括: SEQ  ID NO 7~8所示的核苷酸序列的引物 和SEQ ID NO:9所示核苷酸序列的探针。 6.根据权利要求5所述的构巢曲霉的引物探针, 其特征在于, SEQ  ID NO: 9所示的探针 的5’端标记有荧 光报告基团C Y5‑MGB, 3端标记有荧 光淬灭基团MGB。 7.检测尖端赛多孢子菌、 土曲霉和构巢曲霉的试剂盒, 其特征在于, 包括权利要求1到6 中至少两种菌属所述的引物探针。 8.根据权利要求7所述的尖端赛多孢子菌、 土曲霉和构巢曲霉的试剂盒, 其特征在于, 包括检测外源内参的引物和探针; 所述检测外源内参的引物, 其核苷酸序列如SEQ  ID NO:10~1 1所示; 所述检测外源内参的探针, 核苷酸序列如SEQ  ID NO:12所示。 9.根据权利要求7所述的尖端赛多孢子菌、 土曲霉和构巢曲霉的试剂盒, 其特征在于, 引物探针 针对尖端赛多孢子 菌、 土曲霉、 构巢曲霉 每种菌种的核糖 体基因群的ITS区设计。 10.一种检测尖端赛多孢子菌、 土曲霉和构巢曲霉的方法, 其特征在于, 以待测样品的 DNA为模板, 采用引物组包括如上所述SEQ  ID NO 1~2, SEQ  ID NO 4~5, SEQ  ID NO 7~8, 探针组包括如上所述SEQ  ID NO 3, SEQ ID NO 6, SEQ ID NO 9的引物探针组进行扩增, 若 SEQ ID NO 1~2,SEQ  ID NO 3可以实现对待测样本的DNA的特定性扩增, 则待测样品中含 有尖端赛多孢子菌; 若SEQ  ID NO 4~5,SEQ  ID NO 6可以实现对待测样本的DNA的特定性 扩增, 则待测样品中含有土曲霉; 若SEQ  ID NO 7~8,SEQ  ID NO 9可以实现对待测样本的 DNA的特定性扩增, 则待测样品中含有构巢曲霉。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114908084 A 2尖端赛多孢 子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引物探针及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物检测领域, 特别涉及一种尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引 物探针及其应用。 背景技术 [0002]尖端赛多孢子菌是一种侵袭性和致病性较强的条件致病菌, 在土壤、 污水、 腐物等 受污染的环境中广发存在, 可侵犯人体的多种器官导致多种疾病 形式, 并常引起致死性感 染。 目前临床上诊断尖端赛多孢子菌感染是非常困难的, 因其临床特征和组织病理学与曲 霉病、 镰刀菌病以及其他常见 的透明丝孢霉病非常相似。 目前诊断尖端赛多孢子菌的方式 大多是采用真菌培养的方式, 由于尖端赛多孢子菌在常规的真菌培养基上生长良好, 但是 曲霉菌株不能生长, 以此作为区分尖端赛多孢子菌和曲霉菌的手段, 但真菌培养比较困难 且生长缓慢, 且无法准确地区分曲霉菌株和尖端赛多孢子菌; 还有采用组化 染色、 组织病理 学、 放射学、 血清学以及分子鉴定等多种方式, 其中PCR检测为代表的分子鉴定可以快速准 确地检测到尖端赛多孢子菌, 但是考虑到该菌种菌株间的极大可变性, 需要选择一个相对 稳定的区间才能成功检测到和尖端赛多孢子菌相似的基因型, 也就是说目前利用PCR技术 检测尖端赛多孢子菌的技术依旧存在技术瓶颈, 而若是无法检测到尖端赛多孢子菌, 则无 法针对性 地对其进行治疗, 导 致患者治疗效率差 。 [0003]另外, 曲霉菌病也是导致人肺部疾病或损害免疫系统的一种常规疾病。 曲霉菌病 通常由曲霉导致, 目前检测曲霉感染的主要方法为GM检测, 其缺点是受某些食物或药物的 影响可致假阳性结果。 虽然已有通过P CR检测曲霉属的相关技术研究, 但是不同曲霉之间依 旧是有区分的, 目前临床上缺乏对曲霉属下属科的曲霉进行检测的技 术研究。 发明内容 [0004]本发明的目的在于提供一种尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引 物探针及其 应用, 提供了针对检测尖端赛多孢子菌、 土曲霉、 构巢曲霉的引物探针, 这些引物探针结合 数字PCR技 术快速实现尖端赛多孢子 菌、 土曲霉、 构巢曲霉的快速检测。 [0005]第一方面, 本方案提供了一种尖端赛多孢子菌的引物探针, 包括: SEQ  ID NO 1~2 所示的核苷酸序列的引物和SEQ  ID NO:3所示核苷酸序列的探针。 [0006]其中SEQ ID NO: 1所示的正向引物为: CG GTTGCCTTCTGCGTAGTA A; [0007]SEQ ID NO: 2所示的反向引物为: CGC CGGGACCCAATG; [0008]SEQ ID NO: 3所示的探针为: TCTCT TTTGCAAGCTC。 [0009]针对尖端赛多孢子的保守区域SCE ‑STD设计, 保守区域的长度为: 136bp, 具体序列 为: [0010]CTCGCGACCCCCGTAGGCCCTGAAATACAGTGGCGGTCCCGCCGCGGTTGCCTTCTGCGTAGTA  AGT CTCTTTTGCAAGCTCGCAT TGGGTCCCGGCGGAGGCCTGCCGTCAAACCACCTAACAACTCCAGA TGGTTGACC。 [0011]SEQ ID NO: 3所示的探针的5 ’端标记有荧光报告基团FAM, 3端标记有荧光淬灭基说 明 书 1/9 页 3 CN 114908084 A 3

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