(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210344122.7 (22)申请日 2022.04.02 (71)申请人 合肥戬谷生物科技有限公司 地址 230000 安徽省合肥市蜀山区井岗路 电商产业园1期3号楼4层 (72)发明人 纪春　吴丹丹　刘兆明　许敏敏　 郑凯丽　金哲　 (74)专利代理 机构 北京金智普华知识产权代理 有限公司 1 1401 专利代理师 张晓博 (51)Int.Cl. C12Q 1/6858(2018.01) C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种水稻脆杆基因OsBC1.1A的KASP分子标 记及其应用 (57)摘要 本申请公开了一种水稻脆杆基因OsBC1.1A 的KASP分子 标记及其应用， 所述KASP分子 标记是 水稻的OsBC1编码区的第82位后面插入了一个碱 基T， 编码基因序列位移导致水稻产生脆杆表型。 根据本申请提供的水稻脆杆基因OsBC1.1A的 KASP分子标记进行基因分型， 在PCR扩增后不用 酶切和电泳， 可以高通量检测多个样品， 极大地 极大地提高了检测的效率， 为育种加筛选携带脆 杆基因的水稻育种材料提供了一种高通量， 低成 本的快速 检测的方法， 加快了 育种进程。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图2页 CN 114807326 A 2022.07.29 CN 114807326 A 1.一种水稻脆杆基因OsBC1.1A的KASP分子标记， 其特征在于， 所述KASP分子标记是水 稻的OsBC1编码区的第82位后面插 入了一个碱基T。 2.根据权利要求1所述的KASP分子标记， 其特征在于， 所述分子标记使得水稻的OsBC1 编码区编码基因序列位移导 致水稻产生 脆杆表型。 3.一组用于扩增权利要求1所述KASP分子标记序列的引物， 其特征在于， 所述引物的序 列如SEQ ID No.1、 SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。 4.一种利用权利要求1或2所述KASP分子标记、 权利要求3所述引物筛选脆杆型水稻的 方法， 包括以下步骤： 提取待测水稻样品的DNA； 以权利要求3所述引物进行PCR扩增， 得到PCR产物； 对扩增后的样品进行基因分型检测， 筛选出具有水稻 脆杆突变基因OsBC1.1A的水稻样 品； 对筛选结果进行验证。 5.一种检测权利要求1或2所述KASP分子标记的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包含 权利要求3所述引物以及其 他用于扩增所述KAS P分子标记的试剂。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114807326 A 2一种水稻脆杆基因OsBC1.1A的KASP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本申请涉及水稻育种技术领域， 尤其涉及一种水稻脆杆基因OsB C1.1A的KASP分子 标记及其应用。 背景技术 [0002]水稻秸秆变脆是由于纤维素降低， 半纤维素增加所致， 而脆嫩的秸秆是牛羊饲料 的极好来源， 脆性秸秆对于反刍动物来说适口性 好， 易咀嚼， 易消化， 营养价 值也相对提高。 [0003]筛选到导致水稻脆杆的基因， 对于培育脆杆型水稻具有非常重要的应用价值， 目 前在国内尚无报道针对该水稻基因的分子标记辅助选择育种应用。 另外， 传统的分子标记 操作繁杂， 难以实现批量以及准确检测， 会严重阻碍该基因在水稻分子标记辅助(MAS)育种 过程中的大量应用。 [0004]开发水稻脆杆基因的功能基因标记， 并建立高效、 环境友好的检测体系， 对促进该 基因的商业 化育种中的应用具有重要意 义。 [0005]KASP技术不需要针对每个SNP位点都去合成特异的荧光引物， 它基于自己独特的 ARM PCR原理， 让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增， 这极大地降低了LGC  KASP 的试剂成本， 既有高标准的准确， 又降低了使用成本， 比Taqman还具有更好的位点适应性， 检测结果与表现型一致， 检测过程无需电泳， 减少 了实验操作过程对环境的污染和人体的 伤害。 所以在医学、 农学检测方面LGC  KASP都有非常好的应用。 因此， 开发一种水稻脆杆基 因标记适用于KAS P方法检测SNP位 点是具有重要意 义。 发明内容 [0006]有鉴于此， 本申请的目的在 于提供一种水稻脆杆基因OsB C1.1A的KASP分子标记及 其应用， 以在一定程度上解决上述 技术问题之一。 [0007]第一方面， 本申请实施例公开了一种水稻脆杆基因OsBC1.1A的KASP分子标记， 所 述KASP分子标记是 水稻的OsBC1编码区的第82位后面插 入了一个碱基T。 [0008]本申请实施例中， 所述KASP分子标记使得水稻的OsBC1编码 区编码基因序列位移 导致水稻产生 脆杆表型。 [0009]第二方面， 本申请实施例提供了一组用于扩增第一方面所述KASP分子标记序列的 引物， 其序列如SEQ  ID No.1、 SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。 [0010]第三方面， 本申请实施例提供了利用第一方面所述KASP分子标记、 第二方面所述 引物筛选脆杆型水稻的方法， 包括以下步骤： [0011]提取待测水稻样品的DNA； [0012]以第二方面所述引物进行PCR扩增， 得到PCR产物； [0013]对扩增后的样品进行基因分型检测， 筛选出具有水稻脆杆突变基因OsB C1.1A的水 稻样品； [0014]对筛选结果进行验证。说　明　书 1/4 页 3 CN 114807326 A 3