(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210171289.8
(22)申请日 2022.02.24
(71)申请人 上海交通大 学
地址 200240 上海市闵行区东川路80 0号
(72)发明人 杨杰 夏朝 陈冰 王霁月
(74)专利代理 机构 上海恒慧知识产权代理事务
所(特殊普通 合伙) 31317
专利代理师 徐红银 张琳
(51)Int.Cl.
G06V 20/69(2022.01)
G06V 10/80(2022.01)
G06V 10/764(2022.01)
G06V 10/82(2022.01)
G06K 9/62(2022.01)
(54)发明名称
基于分组信息辅助的R带染色体核型图像识
别方法及系统
(57)摘要
本发明提供一种基于分组信息辅助的R带染
色体核型图像识别方法, 包括: 获得染色体图像;
对所述染色体图像进行归一化处理; 构建染色识
别模型, 所述染色体识别模型以染色体长度分组
和着丝点位置分组作为辅助任务, 染色体识别作
为主任务; 训练所述染色体识别模型; 使用训练
好的染色体识别模型预测类别。 本发 明有效提升
染色体核型的分析效率, 准确地完成染色体的自
动分类和排序, 工序简介, 有较大的应用前 景。
权利要求书2页 说明书6页 附图2页
CN 114550170 A
2022.05.27
CN 114550170 A
1.一种基于分组信息 辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特 征在于, 包括:
获得染色体图像;
对所述染色体图像进行归一 化处理;
构建染色识别模型, 所述染色体识别模型以染色体长度分组和着丝点位置分组作为辅
助任务, 染色体识别作为主任务;
训练所述染色体识别模型;
使用训练好的染色体识别模型 预测类别。
2.根据权利要求1所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述归一 化处理, 包括:
计算所述染色体图像中的每条染色体长度, 以其最小外包矩形的长边长度为染色体长
度;
以46条染色体中最长的染色体长度为标准长度, 建立以所述标准长度为边长的空白的
矩形;
将所述每条染色体垂直 放在所述矩形正中央位置 。
3.根据权利要求1所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述染色识别模型包括主干网络、 两个分组辅助网络和特 征融合网络 。
4.根据权利要求3所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述主干网络包括 4个用于提取图像特 征的残差模块。
5.根据权利要求3所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述两个辅助模块分别为染色体长度分组任务辅助模块和着丝点 位置分组辅助模块;
所述两个辅助模块均包括编码器、 解码器、 全连接层和跃层连接, 其中:
所述全连接层用于对提取 出来的特 征进行分类;
所述跃层连接用于低层与高层特 征的融合;
所述主干网络的第3个残块输 出特征图X3引入至所述着丝点位置分组辅助模块; 所述主
干网络的第4个残块输出 特征图X4引入至所述长度分组任务辅助模块。
6.根据权利要求5所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述特 征融合模块将所述主干网络、 两个辅助模块的输出 特征融合, 用于染色体分类;
融合后的特 征
表示为:
其中DecL和EncL分别表示长度分 组辅助模 块的解码器和编码器, DecP和EncP分别表示着
丝点位置分组辅助模块的解码器和编码器。
7.根据权利要求3所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 所述染色识别模型的损失函数L包括交叉熵损失函数和一 致性损失函数,
L=Lrecog+λ1(LgroupL+LgroupP)+λ2(LconsistL+LconsistP),
其中λ1, λ2为超参数, Lrecog为分类损失函数; LgroupL,LgroupP为分组损失函数, LconsistL,
LconsistP为一致性损失函数;
其中,
x为预测类别分布, y为真实类别标签;权 利 要 求 书 1/2 页
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CN 114550170 A
2所述LconsistL和LconsistP使用余弦相似度计算, 两个特征向量a,b的余弦相似度表示为:
8.根据权利要求5所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法, 其特征在
于, 两个所述辅助模块经过编码后的特征通道数减少到256, 减少对应全连接层的参数, 特
征学习在编码器和解码器内部进行。
9.根据权利要求1 ‑8任一项所述的基于分组信 息辅助的R带染色体核型图像识别方法,
其特征在于, 根据识别结果对染色体进行配对、 排列, 得到最终的染色体排列图。
10.一种基于分组信息 辅助的R带染色体核型图像识别系统, 其特 征在于, 包括:
主干网络模块, 其 提取染色体图像的图像特 征;
染色体长度分组任务辅助模块, 其 提取染色体的长度特 征;
着丝点位置分组辅助模块, 其 提取染色体的着丝点 位置特征;
特征融合模块, 其融合所述图像特征、 长度 特征和着丝点位置特征, 输出用于染色体分
类的融合特 征, 获得识别结果。权 利 要 求 书 2/2 页
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CN 114550170 A
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专利 基于分组信息辅助的R带染色体核型图像识别方法及系统
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